有馬温泉は太古の海水が、フィリピン海プレートによって押し込められ、マグマによって熱せられた地下水が湧出しているのである。つまり、プレートの境目付近から直接湧いている、世界的にも珍しい温泉である。火山のない近畿では、温度80～90°の温泉が湧き出ている、源泉がいくつもある。